D'une superficie totale de 2 395 km², le territoire du SAGE comprend 4 entités :
- le bassin versant de la Leyre et son delta
Superficie de 2 027 km², soit 84 % de la surface du SAGE,
150 km de cours d'eau principaux et affluents.
- les bassins versants des cours d'eau côtiers du bassin d'Arcachon
Superficie de 280 km², soit 12 % de la surface du SAGE,
11 bassins versants : Cires, Bétey, Lanton, Ayguemorte, Tagon, …
- le secteur des lagunes
Superficie de 88 km² soit 4% de la superficie du SAGE,
Concerne les communes dont les lagunes se trouvent hors du bassin versant de la Leyre, mais en relation étroite avec la nappe superficielle.
- la nappe phréatique plio-quaternaire
Nappe superficielle d'un aquifère multicouches.
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